第一，他们对于知识的记录内容要求不同。知识树记录的为课程知识或是简化的内容，需要记录大量的文字信息。如果要对一本书作知识树，可以根据书的目录进行制作，然后再把相关的知识添加进去。所需要记录的信息量很大。
而作为思维导图的发展是有一个中心的主题或知识点开始，向四周放射性扩展和记录所有的与中心主题或知识点，及其相关的内容的关键词，以及图片图表等等。思维导图记录的语言文字相对比较少，因为里面的关键词，都是与所学课程资料息息相关的信息，往往一幅思维导图就能够包含整个课程的主要的关键性的信息资料。
第二，知识树在人的大脑的思维模式上，属于线性思维。整个的知识架构偏向一个方向发展，知识架构的样式如同一个树的剖面图。也正是因为如此人们把这种知识加构成做知识树。优点：整个知识图看起来比较符合人们传统的思维方式，因而觉得比较美观。缺点，如同大纲一样，很难使人对于整个的知识架构一个整体的全面的了解和认识。不同的知识点之间的前后上下联系，很难表现出来。
思维导图整个图形呈放射性结构，符合大脑的放射性思维模式，它更加的符合大脑神经细胞的生理结构，而且也符合大脑记忆的原理和机制模式。整个思维导图看起来就是整个所要掌握的知识的学习地图。知识点和不同分主题之间联系可以用箭头和符号，进行表示和连接。通过阅读思维导图可以使人对整个知识结构做出整体性的认识和了解。缺点，对于对思维导图没有了解和认识的可能，觉得比较混乱。这点可以通过别人对于思维导图的讲解和在自己使用思维导图过程中，很快消失。
第三，知识树在大脑潜能开发方面，并没有什么特别的地方。所使用的主要还是人的左脑的部分功能，偏重于线性思维，逻辑关系，词汇、数字等。
思维导图是全脑开发，除了左脑的语言文字、逻辑关系、词汇、数字等，同时也使用的右脑的色彩、图像、符号、韵律、节奏等。对大脑的潜能的开发起到了积极有效的促进作用。经常的在个人的学习和生活中应用思维导图，对于人的思维模式和思考方式，特别是在创造性思维的培养和提高解决问题的能力方面，都会起到潜移默化的影响。
第四，知识树的表现形式，样式比较单一，不同的人制作的知识树没有什么特别的变化。无法表现出不同的人对于知识的掌握和理解情况。
针对于思维导图，不同的人绘制的思维导图，因为不同的人的知识背景，对问题的看法的不同的，所以制作的思维导图，也不尽相同。它更加的展现了不同的人的思维模式和思考问题的方式。所以说思维导图是一个比较个性化的学习工具。
第五，在于知识共享和团队学习、合作方面，知识树很难在这方面发挥什么作用。而作为思维导图制作，可以让所有的参加学习分组进行合作共同制作集体的思维导图。通过制作集体的思维导图让所有的人获得更深的学习体验，也因此达到节省时间和成本，促进学习小组成员之间的交流和沟通达到知识共享的目标。
而作为思维导图的发展是有一个中心的主题或知识点开始，向四周放射性扩展和记录所有的与中心主题或知识点，及其相关的内容的关键词，以及图片图表等等。思维导图记录的语言文字相对比较少，因为里面的关键词，都是与所学课程资料息息相关的信息，往往一幅思维导图就能够包含整个课程的主要的关键性的信息资料。
第二，知识树在人的大脑的思维模式上，属于线性思维。整个的知识架构偏向一个方向发展，知识架构的样式如同一个树的剖面图。也正是因为如此人们把这种知识加构成做知识树。优点：整个知识图看起来比较符合人们传统的思维方式，因而觉得比较美观。缺点，如同大纲一样，很难使人对于整个的知识架构一个整体的全面的了解和认识。不同的知识点之间的前后上下联系，很难表现出来。
思维导图整个图形呈放射性结构，符合大脑的放射性思维模式，它更加的符合大脑神经细胞的生理结构，而且也符合大脑记忆的原理和机制模式。整个思维导图看起来就是整个所要掌握的知识的学习地图。知识点和不同分主题之间联系可以用箭头和符号，进行表示和连接。通过阅读思维导图可以使人对整个知识结构做出整体性的认识和了解。缺点，对于对思维导图没有了解和认识的可能，觉得比较混乱。这点可以通过别人对于思维导图的讲解和在自己使用思维导图过程中，很快消失。
第三，知识树在大脑潜能开发方面，并没有什么特别的地方。所使用的主要还是人的左脑的部分功能，偏重于线性思维，逻辑关系，词汇、数字等。
思维导图是全脑开发，除了左脑的语言文字、逻辑关系、词汇、数字等，同时也使用的右脑的色彩、图像、符号、韵律、节奏等。对大脑的潜能的开发起到了积极有效的促进作用。经常的在个人的学习和生活中应用思维导图，对于人的思维模式和思考方式，特别是在创造性思维的培养和提高解决问题的能力方面，都会起到潜移默化的影响。
第四，知识树的表现形式，样式比较单一，不同的人制作的知识树没有什么特别的变化。无法表现出不同的人对于知识的掌握和理解情况。
针对于思维导图，不同的人绘制的思维导图，因为不同的人的知识背景，对问题的看法的不同的，所以制作的思维导图，也不尽相同。它更加的展现了不同的人的思维模式和思考问题的方式。所以说思维导图是一个比较个性化的学习工具。
第五，在于知识共享和团队学习、合作方面，知识树很难在这方面发挥什么作用。而作为思维导图制作，可以让所有的参加学习分组进行合作共同制作集体的思维导图。通过制作集体的思维导图让所有的人获得更深的学习体验，也因此达到节省时间和成本，促进学习小组成员之间的交流和沟通达到知识共享的目标。
